微生物是導致膜水處理係統(膜係統)感染的主要因素之一。目前，大多數企業都在使用感染指數。(SDI，也稱FI)微生物感染狀態表征膜係統。SDI這是一個綜合目標。雖然它可以在一定程度上反映微生物對膜係統的感染程度，但它們沒有創造正確的量化關係，無法正確表達微生物對膜係統感染的影響。為了實時評估膜係統的微生物感染水平，有必要對微生物進行檢測。目前微生物的檢測要領有很多，包括懷孕和地麵檢測。.聚合酶鏈反應及時定量(PCR)法.酶聯免疫吸附法.傳感器法.代謝產品的測定方法.間接計數法.Simplate全平皿計數法和色譜法等。這些測試要領主要用於食物。.化妝品.微生物檢測，如飲用水。
這些要點大多是因為設備擺設和試劑比較便宜。.或者因為操縱過程比較複雜。.或者由於試驗前提比較嚴峻，使得其合用局限性受到限製。相對而言，試片法是一種經濟性。.輕便且相對於快速的要領，更容易實施應用。測試片法還包括孕濾紙的測試方法和以及Petrifilm為載體的3M測試片法。但是前兩種檢測限製較高，數值低於平皿栽培法。M測試片法是一種操作輕便的菌落總數測試要領。目前還沒有應用於環境水樣檢測，因此是否可以應用於膜的微生物傳染檢測還需要通過測試來肯定。
